我持有厂里出资办理的叉车证已两年，厂里能扣

厂里不能扣你的叉车证。依据《劳动争议仲裁调解法》，叉车证属个人资格证明，非劳动报酬或赔偿范畴，扣证行为违法。不及时处理可能导致你无法正常从事相关工作，造成经济损失和职业困扰。
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厂里扣证可申请劳动仲裁或协商解决。建议先与厂里沟通协商，若协商无果，再向劳动仲裁机构申请仲裁，以法律手段维护自身权益。
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厂里不能扣证。处理方式：1.与厂里沟通，说明证件属个人所有，要求归还；2.若沟通无果，收集证据，如证件复印件、劳动合同等；3.向劳动仲裁机构提交仲裁申请，附上证据材料；4.等待仲裁结果，若不服可进一步诉讼。